Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NEUROD1Q13562 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NEUROD1Q13562 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEUROD1Q13562 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
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