Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XRCC4Q13426 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XRCC4Q13426 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
XRCC4Q13426 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
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