Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPFIA1Q13136 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPFIA1Q13136 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms