Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT88Q13099 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT88Q13099 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT88Q13099 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT88Q13099 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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