Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC16Q13042 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC16Q13042 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC16Q13042 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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