Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXF2Q12947 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXF2Q12947 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXF2Q12947 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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