Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPQ12770 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPQ12770 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPQ12770 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAPQ12770 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPQ12770 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPQ12770 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPQ12770 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPQ12770 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPQ12770 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPQ12770 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPQ12770 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPQ12770 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAPQ12770 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPQ12770 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAPQ12770 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCAPQ12770 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAPQ12770 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPQ12770 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPQ12770 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
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