Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCBP1Q09161 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCBP1Q09161 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCBP1Q09161 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCBP1Q09161 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms