Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN1BQ07699 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCN1BQ07699 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN1BQ07699 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN1BQ07699 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms