Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 YJL213WYJL213W 996 nt6.65□□□□□ -1.34
ATG17Q06410 RAP1YNL216W 2484 nt6.64□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.64□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 ARG81YML099C 2643 nt6.64□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 OSM1YJR051W 1506 nt6.63□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 COX5AYNL052W 462 nt6.63□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 YPR204WYPR204W 3099 nt6.63□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 FRE5YOR384W 2085 nt6.62□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 YCP4YCR004C 744 nt6.62□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 TRS31YDR472W 852 nt6.62□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 STS1YIR011C 960 nt6.62□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 YJL160CYJL160C 864 nt6.62□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 TOS6YNL300W 309 nt6.62□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 ERV2YPR037C 591 nt6.62□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 SKI2YLR398C 3864 nt6.61□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 CBK1YNL161W 2271 nt6.61□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 CIS3YJL158C 684 nt6.61□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 YJR154WYJR154W 1041 nt6.61□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 ATP23YNR020C 813 nt6.61□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 SPR1YOR190W 1338 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 YCR049CYCR049C 447 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 YDR415CYDR415C 1125 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 DMC1YER179W 1005 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 YMR007WYMR007W 381 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 DPM1YPR183W 804 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 POP1YNL221C 2628 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 ICS3YJL077C 396 nt6.59□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 PEX13YLR191W 1161 nt6.59□□□□□ -1.35
ATG17Q06410 GEF1YJR040W 2340 nt6.59□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 IMA5YJL216C 1746 nt6.59□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 PPM1YDR435C 987 nt6.58□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 EFT2YDR385W 2529 nt6.58□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 EFT1YOR133W 2529 nt6.58□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 GYP8YFL027C 1494 nt6.58□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 FET4YMR319C 1659 nt6.58□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 CIT2YCR005C 1383 nt6.57□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 MFT1YML062C 1179 nt6.57□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 RCR1YBR005W 642 nt6.57□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 TPO3YPR156C 1869 nt6.56□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 URH1YDR400W 1023 nt6.56□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 YGR127WYGR127W 939 nt6.56□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 PUP1YOR157C 786 nt6.56□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 LAG2YOL025W 1983 nt6.55□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 ACS1YAL054C 2142 nt6.55□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 BRN1YBL097W 2265 nt6.55□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 PNS1YOR161C 1620 nt6.55□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 YDL177CYDL177C 513 nt6.55□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 PMT3YOR321W 2262 nt6.54□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 PIL1YGR086C 1020 nt6.54□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 DUS4YLR405W 1104 nt6.54□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 HRB1YNL004W 1365 nt6.54□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 PSP2YML017W 1782 nt6.54□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 snR82snR82 268 nt6.53□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 YPT1YFL038C 621 nt6.53□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 CPT1YNL130C 1182 nt6.53□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 SLG1YOR008C 1137 nt6.53□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 IRC11YOR013W 471 nt6.53□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 SLX5YDL013W 1860 nt6.53□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 HXK2YGL253W 1461 nt6.53□□□□□ -1.36
ATG17Q06410 MIP1YOR330C 3765 nt6.52□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 HEM1YDR232W 1647 nt6.52□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 YML6YML025C 861 nt6.52□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 THI4YGR144W 981 nt6.51□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 NMT1YLR195C 1368 nt6.5□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 TDH1YJL052W 999 nt6.5□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 YJR142WYJR142W 1029 nt6.5□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 YML133CYML133C 4125 nt6.5□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 RGD1YBR260C 2001 nt6.49□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 COX9YDL067C 180 nt6.49□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 CBR1YIL043C 855 nt6.49□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 PAM17YKR065C 594 nt6.49□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 UTR2YEL040W 1404 nt6.49□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 PET494YNR045W 1470 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 CRP1YHR146W 1398 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 GPI11YDR302W 660 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 UTR5YEL035C 501 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 OAC1YKL120W 975 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 YBR113WYBR113W 483 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 RSA4YCR072C 1548 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 YMR034CYMR034C 1305 nt6.48□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 MKK1YOR231W 1527 nt6.47□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 YSC83YHR017W 1158 nt6.47□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 MOD5YOR274W 1287 nt6.47□□□□□ -1.37
ATG17Q06410 KEL1YHR158C 3495 nt6.46□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.6 ms