Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SSBP1Q04837 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSBP1Q04837 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSBP1Q04837 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms