Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNB1Q02641 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNB1Q02641 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNB1Q02641 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNB1Q02641 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNB1Q02641 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNB1Q02641 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNB1Q02641 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNB1Q02641 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNB1Q02641 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNB1Q02641 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNB1Q02641 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CACNB1Q02641 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNB1Q02641 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNB1Q02641 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CACNB1Q02641 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CACNB1Q02641 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CACNB1Q02641 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CACNB1Q02641 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CACNB1Q02641 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
CACNB1Q02641 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CACNB1Q02641 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNB1Q02641 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CACNB1Q02641 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNB1Q02641 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNB1Q02641 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNB1Q02641 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CACNB1Q02641 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CACNB1Q02641 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNB1Q02641 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNB1Q02641 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNB1Q02641 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNB1Q02641 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNB1Q02641 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CACNB1Q02641 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNB1Q02641 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNB1Q02641 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNB1Q02641 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms