Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 KIN1YDR122W 3195 nt6.22□□□□□ -1.41
SKO1Q02100 TFC6YDR362C 2019 nt6.21□□□□□ -1.41
SKO1Q02100 LCP5YER127W 1074 nt6.21□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 YPC1YBR183W 951 nt6.21□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 YJL211CYJL211C 444 nt6.2□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 MBF1YOR298C-A 456 nt6.2□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 CST26YBR042C 1194 nt6.2□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 BDS1YOL164W 1941 nt6.2□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 AGP2YBR132C 1791 nt6.19□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 SKP1YDR328C 585 nt6.19□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 OPI1YHL020C 1215 nt6.19□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 CYS3YAL012W 1185 nt6.19□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 YAH1YPL252C 519 nt6.19□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 FET4YMR319C 1659 nt6.19□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 ICL2YPR006C 1728 nt6.19□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 YDR401WYDR401W 564 nt6.18□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 SNF4YGL115W 969 nt6.18□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 ATF1YOR377W 1578 nt6.18□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 YLL058WYLL058W 1728 nt6.17□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 YCR041WYCR041W 333 nt6.17□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 YLR112WYLR112W 420 nt6.17□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 PRS4YBL068W 981 nt6.17□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 NPL6YMR091C 1308 nt6.17□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 RQC1YDR333C 2172 nt6.17□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 ENP1YBR247C 1452 nt6.16□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 TRR2YHR106W 1029 nt6.16□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 YJL213WYJL213W 996 nt6.16□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 YML122CYML122C 381 nt6.16□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 MPA43YNL249C 1629 nt6.16□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 EEB1YPL095C 1371 nt6.16□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 GAA1YLR088W 1845 nt6.15□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 ACO1YLR304C 2337 nt6.15□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 AI5_BETAQ0075 1065 nt6.15□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 YJL144WYJL144W 315 nt6.15□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 SWP1YMR149W 861 nt6.15□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 MCP1YOR228C 909 nt6.15□□□□□ -1.42
SKO1Q02100 RSP5YER125W 2430 nt6.15□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 GYP8YFL027C 1494 nt6.15□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 GSH1YJL101C 2037 nt6.15□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 SLA2YNL243W 2907 nt6.14□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 YDR327WYDR327W 327 nt6.14□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 TRR1YDR353W 960 nt6.14□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 OPT1YJL212C 2400 nt6.14□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 RDR1YOR380W 1641 nt6.14□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 EDC3YEL015W 1656 nt6.14□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 AIM46YHR199C 933 nt6.13□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 PAM17YKR065C 594 nt6.13□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 MEU1YLR017W 1014 nt6.13□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 MKK1YOR231W 1527 nt6.13□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 QCR6YFR033C 444 nt6.12□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 CCW12YLR110C 402 nt6.12□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 ZIM17YNL310C 525 nt6.12□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 AAD14YNL331C 1131 nt6.12□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 VTS1YOR359W 1572 nt6.11□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 DML1YMR211W 1428 nt6.11□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 YPQ2YDR352W 954 nt6.11□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 YFR006WYFR006W 1608 nt6.1□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 NAF1YNL124W 1479 nt6.1□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 SKY1YMR216C 2229 nt6.1□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 CCT3YJL014W 1605 nt6.1□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 CIT2YCR005C 1383 nt6.09□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 AIM2YAL049C 741 nt6.09□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 PUS4YNL292W 1212 nt6.09□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 PHO85YPL031C 918 nt6.09□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 snR30snR30 606 nt6.09□□□□□ -1.43
SKO1Q02100 NFS1YCL017C 1494 nt6.09□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 ERG24YNL280C 1317 nt6.08□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 PDA1YER178W 1263 nt6.08□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 NTG1YAL015C 1200 nt6.08□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 HMS2YJR147W 1077 nt6.08□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 LGE1YPL055C 999 nt6.08□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 YLL066CYLL066C 3618 nt6.08□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 VBA5YKR105C 1749 nt6.08□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 YGR139WYGR139W 339 nt6.07□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 RTC4YNL254C 1206 nt6.07□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 PAP2YOL115W 1755 nt6.07□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 MHP1YJL042W 4197 nt6.07□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 PGI1YBR196C 1665 nt6.07□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 MCH2YKL221W 1422 nt6.07□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 CYB2YML054C 1776 nt6.06□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 SML1YML058W 315 nt6.06□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 YBL070CYBL070C 321 nt6.06□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 SPE3YPR069C 882 nt6.06□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 PZF1YPR186C 1290 nt6.06□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 TUB1YML085C 1344 nt6.05□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 CDC11YJR076C 1248 nt6.05□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 SUN4YNL066W 1263 nt6.05□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 IME2YJL106W 1938 nt6.05□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 ATG23YLR431C 1362 nt6.05□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 CDC7YDL017W 1524 nt6.04□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 MIP1YOR330C 3765 nt6.04□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 REV7YIL139C 738 nt6.04□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 YOR111WYOR111W 699 nt6.04□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 SMK1YPR054W 1167 nt6.04□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 JIP4YDR475C 2631 nt6.04□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 DRS1YLL008W 2259 nt6.03□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 YHR145CYHR145C 357 nt6.03□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 YLR162WYLR162W 357 nt6.03□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 YMR074CYMR074C 438 nt6.03□□□□□ -1.44
SKO1Q02100 PLB3YOL011W 2061 nt6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.1 ms