Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNC1Q01954 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BNC1Q01954 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BNC1Q01954 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms