Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF2BQ00403 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2BQ00403 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2BQ00403 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2BQ00403 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms