Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBX1P83916 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBX1P83916 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBX1P83916 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBX1P83916 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBX1P83916 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBX1P83916 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX1P83916 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX1P83916 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX1P83916 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CBX1P83916 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CBX1P83916 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CBX1P83916 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CBX1P83916 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CBX1P83916 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CBX1P83916 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX1P83916 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX1P83916 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX1P83916 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX1P83916 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBX1P83916 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBX1P83916 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBX1P83916 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CBX1P83916 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX1P83916 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX1P83916 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX1P83916 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX1P83916 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX1P83916 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX1P83916 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBX1P83916 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBX1P83916 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBX1P83916 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBX1P83916 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBX1P83916 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBX1P83916 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBX1P83916 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBX1P83916 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBX1P83916 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CBX1P83916 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBX1P83916 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBX1P83916 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBX1P83916 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBX1P83916 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBX1P83916 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX1P83916 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX1P83916 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX1P83916 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX1P83916 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBX1P83916 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBX1P83916 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBX1P83916 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBX1P83916 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBX1P83916 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX1P83916 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX1P83916 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX1P83916 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX1P83916 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX1P83916 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX1P83916 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX1P83916 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX1P83916 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX1P83916 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX1P83916 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX1P83916 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX1P83916 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX1P83916 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX1P83916 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX1P83916 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX1P83916 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX1P83916 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX1P83916 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX1P83916 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX1P83916 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX1P83916 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX1P83916 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX1P83916 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX1P83916 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBX1P83916 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBX1P83916 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBX1P83916 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBX1P83916 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBX1P83916 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CBX1P83916 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBX1P83916 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBX1P83916 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBX1P83916 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBX1P83916 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CBX1P83916 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBX1P83916 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBX1P83916 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBX1P83916 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBX1P83916 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBX1P83916 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBX1P83916 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBX1P83916 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBX1P83916 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBX1P83916 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBX1P83916 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CBX1P83916 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms