Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRPAP78324 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIRPAP78324 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIRPAP78324 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms