Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTXN1P60606 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTXN1P60606 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN1P60606 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.3 ms