Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME5P56597 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME5P56597 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NME5P56597 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME5P56597 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME5P56597 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME5P56597 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME5P56597 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME5P56597 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME5P56597 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME5P56597 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME5P56597 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME5P56597 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME5P56597 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME5P56597 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NME5P56597 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME5P56597 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME5P56597 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME5P56597 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME5P56597 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME5P56597 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME5P56597 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME5P56597 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME5P56597 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME5P56597 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME5P56597 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME5P56597 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME5P56597 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME5P56597 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME5P56597 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME5P56597 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME5P56597 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME5P56597 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME5P56597 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME5P56597 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME5P56597 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME5P56597 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME5P56597 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME5P56597 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NME5P56597 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NME5P56597 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME5P56597 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME5P56597 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME5P56597 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME5P56597 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME5P56597 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME5P56597 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME5P56597 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME5P56597 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME5P56597 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME5P56597 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME5P56597 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME5P56597 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME5P56597 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME5P56597 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME5P56597 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME5P56597 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME5P56597 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NME5P56597 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME5P56597 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME5P56597 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NME5P56597 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME5P56597 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME5P56597 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME5P56597 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME5P56597 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME5P56597 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME5P56597 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME5P56597 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME5P56597 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME5P56597 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME5P56597 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME5P56597 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME5P56597 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME5P56597 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME5P56597 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME5P56597 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NME5P56597 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME5P56597 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME5P56597 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME5P56597 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME5P56597 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NME5P56597 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME5P56597 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME5P56597 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME5P56597 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME5P56597 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME5P56597 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME5P56597 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME5P56597 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME5P56597 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NME5P56597 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME5P56597 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME5P56597 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME5P56597 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME5P56597 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME5P56597 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME5P56597 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME5P56597 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME5P56597 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms