Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTBP2P56545 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTBP2P56545 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTBP2P56545 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms