Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMP3P54852 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMP3P54852 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMP3P54852 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EMP3P54852 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMP3P54852 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EMP3P54852 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMP3P54852 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EMP3P54852 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMP3P54852 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMP3P54852 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMP3P54852 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMP3P54852 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMP3P54852 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMP3P54852 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMP3P54852 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMP3P54852 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMP3P54852 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMP3P54852 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMP3P54852 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMP3P54852 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMP3P54852 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMP3P54852 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMP3P54852 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMP3P54852 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMP3P54852 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMP3P54852 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMP3P54852 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMP3P54852 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMP3P54852 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMP3P54852 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMP3P54852 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EMP3P54852 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMP3P54852 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMP3P54852 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMP3P54852 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMP3P54852 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMP3P54852 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMP3P54852 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMP3P54852 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMP3P54852 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EMP3P54852 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EMP3P54852 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMP3P54852 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMP3P54852 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMP3P54852 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMP3P54852 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EMP3P54852 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMP3P54852 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMP3P54852 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMP3P54852 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMP3P54852 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMP3P54852 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMP3P54852 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMP3P54852 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMP3P54852 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMP3P54852 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EMP3P54852 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMP3P54852 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMP3P54852 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EMP3P54852 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMP3P54852 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMP3P54852 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMP3P54852 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMP3P54852 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMP3P54852 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EMP3P54852 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMP3P54852 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMP3P54852 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMP3P54852 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMP3P54852 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMP3P54852 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMP3P54852 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMP3P54852 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMP3P54852 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMP3P54852 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMP3P54852 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMP3P54852 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMP3P54852 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMP3P54852 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EMP3P54852 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMP3P54852 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMP3P54852 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMP3P54852 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMP3P54852 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMP3P54852 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMP3P54852 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMP3P54852 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMP3P54852 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMP3P54852 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMP3P54852 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMP3P54852 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMP3P54852 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMP3P54852 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMP3P54852 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMP3P54852 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMP3P54852 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMP3P54852 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMP3P54852 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EMP3P54852 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.9 ms