Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS6KA3P51812 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA3P51812 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KA3P51812 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KA3P51812 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KA3P51812 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KA3P51812 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KA3P51812 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KA3P51812 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms