Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYB561P49447 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYB561P49447 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYB561P49447 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYB561P49447 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYB561P49447 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYB561P49447 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CYB561P49447 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYB561P49447 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYB561P49447 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYB561P49447 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYB561P49447 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYB561P49447 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYB561P49447 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYB561P49447 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYB561P49447 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYB561P49447 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYB561P49447 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYB561P49447 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYB561P49447 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYB561P49447 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYB561P49447 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYB561P49447 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYB561P49447 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYB561P49447 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CYB561P49447 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYB561P49447 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYB561P49447 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYB561P49447 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYB561P49447 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYB561P49447 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYB561P49447 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYB561P49447 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYB561P49447 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYB561P49447 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYB561P49447 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYB561P49447 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYB561P49447 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYB561P49447 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYB561P49447 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYB561P49447 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYB561P49447 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYB561P49447 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYB561P49447 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYB561P49447 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYB561P49447 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYB561P49447 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYB561P49447 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYB561P49447 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYB561P49447 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYB561P49447 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYB561P49447 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYB561P49447 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYB561P49447 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYB561P49447 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYB561P49447 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYB561P49447 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYB561P49447 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYB561P49447 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYB561P49447 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYB561P49447 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYB561P49447 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYB561P49447 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYB561P49447 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYB561P49447 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYB561P49447 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYB561P49447 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CYB561P49447 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYB561P49447 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYB561P49447 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYB561P49447 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYB561P49447 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYB561P49447 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYB561P49447 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYB561P49447 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYB561P49447 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYB561P49447 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYB561P49447 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYB561P49447 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYB561P49447 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYB561P49447 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYB561P49447 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYB561P49447 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYB561P49447 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYB561P49447 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYB561P49447 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYB561P49447 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYB561P49447 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYB561P49447 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYB561P49447 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYB561P49447 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYB561P49447 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYB561P49447 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYB561P49447 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYB561P49447 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYB561P49447 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYB561P49447 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYB561P49447 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYB561P49447 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYB561P49447 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms