Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP5P45974 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP5P45974 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP5P45974 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
USP5P45974 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP5P45974 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP5P45974 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP5P45974 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP5P45974 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP5P45974 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
USP5P45974 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP5P45974 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP5P45974 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP5P45974 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
USP5P45974 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP5P45974 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP5P45974 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP5P45974 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP5P45974 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP5P45974 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP5P45974 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP5P45974 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP5P45974 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP5P45974 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP5P45974 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP5P45974 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP5P45974 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP5P45974 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
USP5P45974 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP5P45974 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
USP5P45974 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP5P45974 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP5P45974 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP5P45974 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP5P45974 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
USP5P45974 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP5P45974 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP5P45974 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP5P45974 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
USP5P45974 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP5P45974 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP5P45974 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP5P45974 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP5P45974 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
USP5P45974 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP5P45974 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP5P45974 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP5P45974 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP5P45974 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP5P45974 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP5P45974 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP5P45974 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP5P45974 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP5P45974 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP5P45974 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP5P45974 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
USP5P45974 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP5P45974 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP5P45974 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
USP5P45974 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP5P45974 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP5P45974 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
USP5P45974 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
USP5P45974 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP5P45974 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP5P45974 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP5P45974 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP5P45974 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP5P45974 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP5P45974 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP5P45974 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
USP5P45974 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
USP5P45974 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
USP5P45974 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP5P45974 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP5P45974 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP5P45974 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP5P45974 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
USP5P45974 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP5P45974 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP5P45974 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP5P45974 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP5P45974 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP5P45974 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP5P45974 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP5P45974 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
USP5P45974 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP5P45974 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP5P45974 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP5P45974 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP5P45974 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP5P45974 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP5P45974 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP5P45974 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP5P45974 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP5P45974 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP5P45974 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
USP5P45974 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP5P45974 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP5P45974 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms