Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP13P45452 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP13P45452 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP13P45452 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP13P45452 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP13P45452 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP13P45452 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP13P45452 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMP13P45452 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP13P45452 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP13P45452 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP13P45452 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP13P45452 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP13P45452 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP13P45452 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP13P45452 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP13P45452 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP13P45452 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP13P45452 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP13P45452 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMP13P45452 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MMP13P45452 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MMP13P45452 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP13P45452 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP13P45452 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP13P45452 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP13P45452 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP13P45452 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP13P45452 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP13P45452 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP13P45452 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP13P45452 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP13P45452 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP13P45452 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP13P45452 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP13P45452 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP13P45452 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP13P45452 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP13P45452 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP13P45452 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP13P45452 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP13P45452 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP13P45452 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP13P45452 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP13P45452 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP13P45452 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP13P45452 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
MMP13P45452 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP13P45452 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP13P45452 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP13P45452 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP13P45452 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP13P45452 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP13P45452 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP13P45452 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP13P45452 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP13P45452 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP13P45452 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP13P45452 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP13P45452 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP13P45452 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP13P45452 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP13P45452 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP13P45452 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP13P45452 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP13P45452 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP13P45452 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP13P45452 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP13P45452 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP13P45452 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP13P45452 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP13P45452 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP13P45452 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP13P45452 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP13P45452 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP13P45452 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP13P45452 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP13P45452 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP13P45452 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP13P45452 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP13P45452 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP13P45452 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP13P45452 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP13P45452 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP13P45452 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP13P45452 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP13P45452 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP13P45452 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP13P45452 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP13P45452 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP13P45452 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP13P45452 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP13P45452 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP13P45452 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP13P45452 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP13P45452 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP13P45452 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP13P45452 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP13P45452 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP13P45452 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms