Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASP2P42575 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP2P42575 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP2P42575 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP2P42575 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP2P42575 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASP2P42575 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP2P42575 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP2P42575 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP2P42575 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP2P42575 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP2P42575 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP2P42575 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP2P42575 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP2P42575 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP2P42575 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP2P42575 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP2P42575 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP2P42575 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP2P42575 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP2P42575 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP2P42575 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP2P42575 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP2P42575 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASP2P42575 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP2P42575 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP2P42575 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP2P42575 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP2P42575 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP2P42575 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP2P42575 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP2P42575 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP2P42575 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP2P42575 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP2P42575 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP2P42575 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP2P42575 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP2P42575 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP2P42575 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP2P42575 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP2P42575 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP2P42575 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP2P42575 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP2P42575 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP2P42575 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP2P42575 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP2P42575 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP2P42575 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP2P42575 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP2P42575 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP2P42575 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP2P42575 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP2P42575 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP2P42575 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP2P42575 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP2P42575 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP2P42575 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP2P42575 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP2P42575 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP2P42575 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP2P42575 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP2P42575 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP2P42575 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP2P42575 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CASP2P42575 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP2P42575 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP2P42575 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP2P42575 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP2P42575 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP2P42575 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP2P42575 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP2P42575 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP2P42575 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP2P42575 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP2P42575 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP2P42575 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP2P42575 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP2P42575 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP2P42575 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP2P42575 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP2P42575 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP2P42575 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP2P42575 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP2P42575 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP2P42575 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP2P42575 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP2P42575 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP2P42575 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP2P42575 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP2P42575 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP2P42575 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP2P42575 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP2P42575 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASP2P42575 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASP2P42575 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP2P42575 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP2P42575 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP2P42575 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP2P42575 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP2P42575 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms