Protein–RNA interactions for Protein: P42357

HAL, Histidine ammonia-lyase, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HALP42357 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HALP42357 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HALP42357 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HALP42357 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HALP42357 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HALP42357 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HALP42357 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HALP42357 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HALP42357 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HALP42357 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HALP42357 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HALP42357 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HALP42357 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HALP42357 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HALP42357 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HALP42357 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HALP42357 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HALP42357 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HALP42357 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HALP42357 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HALP42357 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HALP42357 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HALP42357 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HALP42357 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HALP42357 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HALP42357 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HALP42357 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HALP42357 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HALP42357 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HALP42357 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HALP42357 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HALP42357 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HALP42357 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HALP42357 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HALP42357 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HALP42357 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HALP42357 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HALP42357 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
HALP42357 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HALP42357 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HALP42357 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HALP42357 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HALP42357 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HALP42357 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HALP42357 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HALP42357 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HALP42357 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HALP42357 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HALP42357 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HALP42357 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HALP42357 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HALP42357 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HALP42357 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HALP42357 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HALP42357 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HALP42357 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HALP42357 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HALP42357 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HALP42357 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HALP42357 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HALP42357 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HALP42357 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HALP42357 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HALP42357 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HALP42357 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HALP42357 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HALP42357 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HALP42357 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HALP42357 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HALP42357 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HALP42357 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HALP42357 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HALP42357 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HALP42357 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HALP42357 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HALP42357 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HALP42357 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HALP42357 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HALP42357 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HALP42357 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HALP42357 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HALP42357 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HALP42357 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HALP42357 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HALP42357 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HALP42357 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HALP42357 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HALP42357 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HALP42357 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HALP42357 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HALP42357 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HALP42357 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HALP42357 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HALP42357 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HALP42357 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HALP42357 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HALP42357 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HALP42357 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HALP42357 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HALP42357 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms