Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX2P40425 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX2P40425 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX2P40425 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX2P40425 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX2P40425 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PBX2P40425 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBX2P40425 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBX2P40425 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PBX2P40425 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PBX2P40425 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PBX2P40425 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PBX2P40425 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PBX2P40425 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PBX2P40425 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PBX2P40425 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PBX2P40425 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PBX2P40425 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PBX2P40425 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PBX2P40425 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PBX2P40425 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PBX2P40425 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PBX2P40425 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PBX2P40425 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PBX2P40425 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PBX2P40425 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PBX2P40425 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PBX2P40425 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PBX2P40425 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PBX2P40425 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PBX2P40425 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PBX2P40425 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PBX2P40425 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PBX2P40425 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PBX2P40425 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PBX2P40425 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PBX2P40425 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PBX2P40425 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PBX2P40425 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PBX2P40425 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PBX2P40425 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PBX2P40425 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PBX2P40425 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PBX2P40425 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PBX2P40425 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PBX2P40425 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PBX2P40425 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PBX2P40425 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PBX2P40425 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PBX2P40425 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PBX2P40425 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PBX2P40425 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PBX2P40425 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PBX2P40425 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PBX2P40425 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PBX2P40425 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PBX2P40425 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PBX2P40425 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBX2P40425 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBX2P40425 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBX2P40425 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PBX2P40425 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PBX2P40425 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBX2P40425 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PBX2P40425 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBX2P40425 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PBX2P40425 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PBX2P40425 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PBX2P40425 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PBX2P40425 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PBX2P40425 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PBX2P40425 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PBX2P40425 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PBX2P40425 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PBX2P40425 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PBX2P40425 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PBX2P40425 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PBX2P40425 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PBX2P40425 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PBX2P40425 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PBX2P40425 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBX2P40425 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBX2P40425 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBX2P40425 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PBX2P40425 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PBX2P40425 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBX2P40425 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBX2P40425 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBX2P40425 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBX2P40425 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBX2P40425 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PBX2P40425 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBX2P40425 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBX2P40425 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBX2P40425 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBX2P40425 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PBX2P40425 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBX2P40425 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PBX2P40425 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PBX2P40425 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms