Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIPAP38571 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIPAP38571 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIPAP38571 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIPAP38571 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPAP38571 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPAP38571 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPAP38571 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPAP38571 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPAP38571 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPAP38571 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPAP38571 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPAP38571 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPAP38571 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPAP38571 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPAP38571 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPAP38571 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPAP38571 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPAP38571 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPAP38571 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPAP38571 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPAP38571 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPAP38571 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPAP38571 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPAP38571 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPAP38571 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPAP38571 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPAP38571 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPAP38571 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPAP38571 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPAP38571 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPAP38571 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPAP38571 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPAP38571 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPAP38571 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIPAP38571 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPAP38571 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPAP38571 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPAP38571 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPAP38571 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPAP38571 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPAP38571 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPAP38571 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPAP38571 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPAP38571 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPAP38571 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPAP38571 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPAP38571 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPAP38571 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPAP38571 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPAP38571 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPAP38571 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPAP38571 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPAP38571 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPAP38571 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPAP38571 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPAP38571 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPAP38571 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPAP38571 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPAP38571 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPAP38571 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPAP38571 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPAP38571 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPAP38571 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPAP38571 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPAP38571 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPAP38571 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPAP38571 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPAP38571 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPAP38571 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPAP38571 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPAP38571 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPAP38571 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPAP38571 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPAP38571 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPAP38571 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPAP38571 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPAP38571 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPAP38571 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPAP38571 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPAP38571 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPAP38571 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPAP38571 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPAP38571 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPAP38571 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPAP38571 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPAP38571 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPAP38571 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPAP38571 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPAP38571 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPAP38571 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPAP38571 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPAP38571 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPAP38571 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPAP38571 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPAP38571 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPAP38571 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPAP38571 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPAP38571 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPAP38571 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms