Protein–RNA interactions for Protein: P36130

CAF4, CCR4-associated factor 4, yeastyeast

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CAF4P36130 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.68□□□□□ -1.34
CAF4P36130 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.68□□□□□ -1.34
CAF4P36130 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.68□□□□□ -1.34
CAF4P36130 YNR005CYNR005C 405 nt6.68□□□□□ -1.34
CAF4P36130 HTZ1YOL012C 405 nt6.68□□□□□ -1.34
CAF4P36130 NTG2YOL043C 1143 nt6.68□□□□□ -1.34
CAF4P36130 HBN1YCL026C-B 582 nt6.68□□□□□ -1.34
CAF4P36130 TAH11YJR046W 1815 nt6.68□□□□□ -1.34
CAF4P36130 SEC23YPR181C 2307 nt6.67□□□□□ -1.34
CAF4P36130 EFM1YHL039W 1758 nt6.67□□□□□ -1.34
CAF4P36130 YCL049CYCL049C 939 nt6.67□□□□□ -1.34
CAF4P36130 CCT3YJL014W 1605 nt6.66□□□□□ -1.34
CAF4P36130 RPL2BYIL018W 765 nt6.66□□□□□ -1.34
CAF4P36130 REC107YJR021C 945 nt6.66□□□□□ -1.34
CAF4P36130 VBA5YKR105C 1749 nt6.66□□□□□ -1.34
CAF4P36130 YLL058WYLL058W 1728 nt6.66□□□□□ -1.34
CAF4P36130 GPA1YHR005C 1419 nt6.66□□□□□ -1.34
CAF4P36130 SSC1YJR045C 1965 nt6.66□□□□□ -1.34
CAF4P36130 PAC2YER007W 1557 nt6.65□□□□□ -1.34
CAF4P36130 YOR389WYOR389W 1875 nt6.64□□□□□ -1.35
CAF4P36130 YLR162WYLR162W 357 nt6.64□□□□□ -1.35
CAF4P36130 YPL247CYPL247C 1572 nt6.64□□□□□ -1.35
CAF4P36130 GSH1YJL101C 2037 nt6.64□□□□□ -1.35
CAF4P36130 URH1YDR400W 1023 nt6.63□□□□□ -1.35
CAF4P36130 PTC7YHR076W 1032 nt6.63□□□□□ -1.35
CAF4P36130 TPK1YJL164C 1194 nt6.63□□□□□ -1.35
CAF4P36130 RPL31BYLR406C 342 nt6.63□□□□□ -1.35
CAF4P36130 SPG5YMR191W 1122 nt6.63□□□□□ -1.35
CAF4P36130 PRE5YMR314W 705 nt6.63□□□□□ -1.35
CAF4P36130 YOR268CYOR268C 399 nt6.63□□□□□ -1.35
CAF4P36130 APE4YHR113W 1473 nt6.62□□□□□ -1.35
CAF4P36130 TRS31YDR472W 852 nt6.62□□□□□ -1.35
CAF4P36130 CBR1YIL043C 855 nt6.62□□□□□ -1.35
CAF4P36130 DPH5YLR172C 903 nt6.62□□□□□ -1.35
CAF4P36130 RQC1YDR333C 2172 nt6.62□□□□□ -1.35
CAF4P36130 RGD2YFL047W 2145 nt6.61□□□□□ -1.35
CAF4P36130 ECM30YLR436C 3825 nt6.61□□□□□ -1.35
CAF4P36130 GPH1YPR160W 2709 nt6.61□□□□□ -1.35
CAF4P36130 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.6□□□□□ -1.35
CAF4P36130 COX16YJL003W 357 nt6.6□□□□□ -1.35
CAF4P36130 YOX1YML027W 1158 nt6.6□□□□□ -1.35
CAF4P36130 YNR014WYNR014W 639 nt6.6□□□□□ -1.35
CAF4P36130 YGL102CYGL102C 429 nt6.59□□□□□ -1.35
CAF4P36130 AIM46YHR199C 933 nt6.59□□□□□ -1.35
CAF4P36130 HMS2YJR147W 1077 nt6.59□□□□□ -1.35
CAF4P36130 RPR1RPR1 369 nt6.59□□□□□ -1.35
CAF4P36130 RGT2YDL138W 2292 nt6.59□□□□□ -1.36
CAF4P36130 YDL177CYDL177C 513 nt6.58□□□□□ -1.36
CAF4P36130 MEU1YLR017W 1014 nt6.58□□□□□ -1.36
CAF4P36130 SMX3YPR182W 261 nt6.58□□□□□ -1.36
CAF4P36130 EMP65YER140W 1671 nt6.58□□□□□ -1.36
CAF4P36130 LAT1YNL071W 1449 nt6.58□□□□□ -1.36
CAF4P36130 YMR034CYMR034C 1305 nt6.57□□□□□ -1.36
CAF4P36130 MRPS28YDR337W 861 nt6.57□□□□□ -1.36
CAF4P36130 Q0010Q0010 387 nt6.57□□□□□ -1.36
CAF4P36130 YLL066CYLL066C 3618 nt6.57□□□□□ -1.36
CAF4P36130 YSC83YHR017W 1158 nt6.56□□□□□ -1.36
CAF4P36130 OPI11YPR044C 354 nt6.56□□□□□ -1.36
CAF4P36130 SLA2YNL243W 2907 nt6.55□□□□□ -1.36
CAF4P36130 PPH22YDL188C 1134 nt6.55□□□□□ -1.36
CAF4P36130 PRI1YIR008C 1230 nt6.55□□□□□ -1.36
CAF4P36130 YLL056CYLL056C 897 nt6.55□□□□□ -1.36
CAF4P36130 ERG10YPL028W 1197 nt6.55□□□□□ -1.36
CAF4P36130 PEX31YGR004W 1389 nt6.55□□□□□ -1.36
CAF4P36130 ICP55YER078C 1536 nt6.55□□□□□ -1.36
CAF4P36130 YJL163CYJL163C 1668 nt6.55□□□□□ -1.36
CAF4P36130 YHR131CYHR131C 2553 nt6.54□□□□□ -1.36
CAF4P36130 ERP2YAL007C 648 nt6.54□□□□□ -1.36
CAF4P36130 SML1YML058W 315 nt6.54□□□□□ -1.36
CAF4P36130 RRN10YBL025W 438 nt6.54□□□□□ -1.36
CAF4P36130 RPL5YPL131W 894 nt6.54□□□□□ -1.36
CAF4P36130 AIM3YBR108W 2844 nt6.54□□□□□ -1.36
CAF4P36130 DYS1YHR068W 1164 nt6.53□□□□□ -1.36
CAF4P36130 MRPL19YNL185C 477 nt6.53□□□□□ -1.36
CAF4P36130 ZIM17YNL310C 525 nt6.53□□□□□ -1.36
CAF4P36130 MFG1YDL233W 1377 nt6.53□□□□□ -1.36
CAF4P36130 FCY22YER060W-A 1593 nt6.52□□□□□ -1.36
CAF4P36130 MSC3YLR219W 2187 nt6.52□□□□□ -1.36
CAF4P36130 HED1YDR014W-A 489 nt6.52□□□□□ -1.37
CAF4P36130 GCN3YKR026C 918 nt6.52□□□□□ -1.37
CAF4P36130 IRC11YOR013W 471 nt6.52□□□□□ -1.37
CAF4P36130 FIT2YOR382W 462 nt6.52□□□□□ -1.37
CAF4P36130 SEC62YPL094C 825 nt6.52□□□□□ -1.37
CAF4P36130 SMK1YPR054W 1167 nt6.52□□□□□ -1.37
CAF4P36130 HOG1YLR113W 1308 nt6.51□□□□□ -1.37
CAF4P36130 YHR020WYHR020W 2067 nt6.51□□□□□ -1.37
CAF4P36130 HGH1YGR187C 1185 nt6.51□□□□□ -1.37
CAF4P36130 OPI8YKR035C 642 nt6.51□□□□□ -1.37
CAF4P36130 YPR076WYPR076W 375 nt6.51□□□□□ -1.37
CAF4P36130 PPM2YOL141W 2088 nt6.51□□□□□ -1.37
CAF4P36130 NUP49YGL172W 1419 nt6.5□□□□□ -1.37
CAF4P36130 HAL5YJL165C 2568 nt6.5□□□□□ -1.37
CAF4P36130 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.5□□□□□ -1.37
CAF4P36130 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.5□□□□□ -1.37
CAF4P36130 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.5□□□□□ -1.37
CAF4P36130 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.5□□□□□ -1.37
CAF4P36130 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.5□□□□□ -1.37
CAF4P36130 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.5□□□□□ -1.37
CAF4P36130 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.5□□□□□ -1.37
CAF4P36130 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 120.1 ms