Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRABP1P29762 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRABP1P29762 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRABP1P29762 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRABP1P29762 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms