Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBL1P28749 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBL1P28749 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBL1P28749 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBL1P28749 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBL1P28749 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBL1P28749 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBL1P28749 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RBL1P28749 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBL1P28749 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBL1P28749 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBL1P28749 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBL1P28749 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBL1P28749 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBL1P28749 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBL1P28749 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBL1P28749 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBL1P28749 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RBL1P28749 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RBL1P28749 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBL1P28749 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RBL1P28749 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBL1P28749 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBL1P28749 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBL1P28749 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RBL1P28749 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBL1P28749 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBL1P28749 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBL1P28749 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBL1P28749 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBL1P28749 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBL1P28749 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBL1P28749 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RBL1P28749 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBL1P28749 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBL1P28749 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBL1P28749 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBL1P28749 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBL1P28749 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBL1P28749 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBL1P28749 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBL1P28749 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBL1P28749 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBL1P28749 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBL1P28749 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBL1P28749 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBL1P28749 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBL1P28749 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBL1P28749 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBL1P28749 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBL1P28749 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBL1P28749 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBL1P28749 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBL1P28749 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBL1P28749 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBL1P28749 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBL1P28749 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBL1P28749 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBL1P28749 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBL1P28749 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBL1P28749 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBL1P28749 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBL1P28749 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBL1P28749 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBL1P28749 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBL1P28749 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBL1P28749 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL1P28749 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL1P28749 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL1P28749 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL1P28749 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBL1P28749 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBL1P28749 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBL1P28749 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBL1P28749 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBL1P28749 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBL1P28749 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBL1P28749 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBL1P28749 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBL1P28749 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBL1P28749 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RBL1P28749 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBL1P28749 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBL1P28749 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBL1P28749 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBL1P28749 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBL1P28749 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBL1P28749 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBL1P28749 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBL1P28749 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RBL1P28749 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL1P28749 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL1P28749 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL1P28749 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL1P28749 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL1P28749 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBL1P28749 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBL1P28749 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBL1P28749 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBL1P28749 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms