Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NR4A1P22736 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR4A1P22736 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms