Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD247P20963 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD247P20963 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD247P20963 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD247P20963 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD247P20963 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD247P20963 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD247P20963 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD247P20963 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD247P20963 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD247P20963 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD247P20963 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD247P20963 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD247P20963 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD247P20963 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD247P20963 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD247P20963 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD247P20963 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD247P20963 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD247P20963 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD247P20963 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD247P20963 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD247P20963 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD247P20963 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD247P20963 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD247P20963 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD247P20963 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD247P20963 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD247P20963 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD247P20963 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD247P20963 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD247P20963 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD247P20963 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD247P20963 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD247P20963 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CD247P20963 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CD247P20963 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD247P20963 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD247P20963 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD247P20963 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD247P20963 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD247P20963 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD247P20963 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD247P20963 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD247P20963 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD247P20963 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD247P20963 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD247P20963 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD247P20963 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD247P20963 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD247P20963 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD247P20963 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD247P20963 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD247P20963 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD247P20963 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD247P20963 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD247P20963 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD247P20963 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD247P20963 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD247P20963 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD247P20963 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD247P20963 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD247P20963 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD247P20963 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD247P20963 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD247P20963 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CD247P20963 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD247P20963 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD247P20963 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD247P20963 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CD247P20963 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD247P20963 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD247P20963 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD247P20963 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD247P20963 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD247P20963 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD247P20963 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD247P20963 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD247P20963 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD247P20963 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD247P20963 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD247P20963 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD247P20963 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD247P20963 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD247P20963 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD247P20963 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD247P20963 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD247P20963 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD247P20963 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD247P20963 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD247P20963 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD247P20963 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD247P20963 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD247P20963 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD247P20963 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD247P20963 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD247P20963 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD247P20963 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD247P20963 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD247P20963 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms