Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTF3P20783 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTF3P20783 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTF3P20783 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTF3P20783 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTF3P20783 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTF3P20783 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTF3P20783 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTF3P20783 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTF3P20783 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTF3P20783 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTF3P20783 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NTF3P20783 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF3P20783 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF3P20783 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF3P20783 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF3P20783 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NTF3P20783 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF3P20783 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF3P20783 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF3P20783 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF3P20783 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NTF3P20783 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF3P20783 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF3P20783 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF3P20783 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF3P20783 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NTF3P20783 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF3P20783 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF3P20783 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF3P20783 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF3P20783 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF3P20783 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF3P20783 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NTF3P20783 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF3P20783 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF3P20783 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF3P20783 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF3P20783 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF3P20783 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF3P20783 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF3P20783 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF3P20783 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NTF3P20783 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF3P20783 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF3P20783 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF3P20783 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF3P20783 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF3P20783 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF3P20783 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF3P20783 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF3P20783 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF3P20783 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF3P20783 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF3P20783 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF3P20783 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTF3P20783 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTF3P20783 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTF3P20783 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTF3P20783 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NTF3P20783 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF3P20783 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF3P20783 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF3P20783 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF3P20783 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF3P20783 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF3P20783 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF3P20783 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF3P20783 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF3P20783 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTF3P20783 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF3P20783 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF3P20783 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF3P20783 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF3P20783 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF3P20783 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF3P20783 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF3P20783 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF3P20783 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF3P20783 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF3P20783 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTF3P20783 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF3P20783 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF3P20783 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF3P20783 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF3P20783 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF3P20783 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF3P20783 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF3P20783 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF3P20783 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF3P20783 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF3P20783 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTF3P20783 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF3P20783 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF3P20783 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF3P20783 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTF3P20783 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF3P20783 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF3P20783 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF3P20783 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms