Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC1P18887 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XRCC1P18887 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XRCC1P18887 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XRCC1P18887 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XRCC1P18887 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XRCC1P18887 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XRCC1P18887 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XRCC1P18887 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XRCC1P18887 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XRCC1P18887 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
XRCC1P18887 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
XRCC1P18887 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XRCC1P18887 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XRCC1P18887 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XRCC1P18887 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XRCC1P18887 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms