Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-EP13747 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-EP13747 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-EP13747 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-EP13747 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-EP13747 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-EP13747 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-EP13747 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms