Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RALAP11233 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RALAP11233 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RALAP11233 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RALAP11233 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RALAP11233 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RALAP11233 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RALAP11233 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RALAP11233 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RALAP11233 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALAP11233 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALAP11233 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALAP11233 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALAP11233 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALAP11233 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RALAP11233 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RALAP11233 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RALAP11233 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RALAP11233 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RALAP11233 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RALAP11233 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RALAP11233 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RALAP11233 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RALAP11233 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RALAP11233 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RALAP11233 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RALAP11233 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RALAP11233 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RALAP11233 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RALAP11233 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RALAP11233 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RALAP11233 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RALAP11233 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RALAP11233 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RALAP11233 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RALAP11233 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RALAP11233 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RALAP11233 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RALAP11233 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RALAP11233 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RALAP11233 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RALAP11233 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RALAP11233 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RALAP11233 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RALAP11233 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RALAP11233 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RALAP11233 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RALAP11233 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RALAP11233 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RALAP11233 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RALAP11233 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RALAP11233 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RALAP11233 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RALAP11233 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RALAP11233 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RALAP11233 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RALAP11233 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RALAP11233 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RALAP11233 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RALAP11233 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RALAP11233 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RALAP11233 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RALAP11233 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RALAP11233 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RALAP11233 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RALAP11233 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RALAP11233 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RALAP11233 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RALAP11233 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RALAP11233 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RALAP11233 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RALAP11233 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RALAP11233 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RALAP11233 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RALAP11233 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RALAP11233 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RALAP11233 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RALAP11233 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RALAP11233 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RALAP11233 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RALAP11233 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RALAP11233 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RALAP11233 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RALAP11233 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RALAP11233 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RALAP11233 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RALAP11233 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RALAP11233 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RALAP11233 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RALAP11233 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RALAP11233 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RALAP11233 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RALAP11233 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RALAP11233 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RALAP11233 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RALAP11233 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RALAP11233 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RALAP11233 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RALAP11233 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RALAP11233 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms