Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P0DMU3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P0DMU3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P0DMU3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P0DMU3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P0DMU3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P0DMU3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P0DMU3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P0DMU3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P0DMU3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P0DMU3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P0DMU3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
P0DMU3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P0DMU3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P0DMU3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P0DMU3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P0DMU3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P0DMU3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P0DMU3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P0DMU3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P0DMU3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P0DMU3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P0DMU3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
P0DMU3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P0DMU3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P0DMU3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P0DMU3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P0DMU3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P0DMU3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P0DMU3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P0DMU3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P0DMU3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P0DMU3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P0DMU3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P0DMU3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P0DMU3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P0DMU3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P0DMU3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P0DMU3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P0DMU3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P0DMU3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P0DMU3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P0DMU3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P0DMU3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P0DMU3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P0DMU3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P0DMU3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P0DMU3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P0DMU3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P0DMU3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P0DMU3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P0DMU3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P0DMU3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
P0DMU3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P0DMU3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P0DMU3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P0DMU3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P0DMU3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P0DMU3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P0DMU3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P0DMU3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P0DMU3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P0DMU3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P0DMU3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P0DMU3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P0DMU3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P0DMU3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P0DMU3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P0DMU3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P0DMU3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P0DMU3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P0DMU3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P0DMU3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P0DMU3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P0DMU3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P0DMU3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P0DMU3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P0DMU3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P0DMU3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P0DMU3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P0DMU3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P0DMU3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P0DMU3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P0DMU3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P0DMU3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P0DMU3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P0DMU3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P0DMU3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P0DMU3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P0DMU3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P0DMU3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P0DMU3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P0DMU3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P0DMU3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P0DMU3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P0DMU3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P0DMU3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P0DMU3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P0DMU3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
P0DMU3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms