Protein–RNA interactions for Protein: P08779

KRT16, Keratin, type I cytoskeletal 16, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT16P08779 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT16P08779 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT16P08779 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT16P08779 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT16P08779 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT16P08779 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT16P08779 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT16P08779 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT16P08779 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT16P08779 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT16P08779 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT16P08779 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT16P08779 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT16P08779 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT16P08779 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT16P08779 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT16P08779 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT16P08779 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT16P08779 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT16P08779 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT16P08779 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT16P08779 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT16P08779 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT16P08779 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT16P08779 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT16P08779 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT16P08779 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT16P08779 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT16P08779 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT16P08779 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT16P08779 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT16P08779 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT16P08779 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT16P08779 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT16P08779 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT16P08779 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT16P08779 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT16P08779 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT16P08779 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT16P08779 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT16P08779 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT16P08779 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT16P08779 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT16P08779 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT16P08779 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT16P08779 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT16P08779 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT16P08779 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT16P08779 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT16P08779 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT16P08779 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT16P08779 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT16P08779 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT16P08779 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT16P08779 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT16P08779 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT16P08779 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT16P08779 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT16P08779 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT16P08779 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT16P08779 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT16P08779 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT16P08779 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT16P08779 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT16P08779 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT16P08779 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT16P08779 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT16P08779 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT16P08779 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT16P08779 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT16P08779 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT16P08779 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT16P08779 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT16P08779 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT16P08779 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT16P08779 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT16P08779 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT16P08779 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT16P08779 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT16P08779 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT16P08779 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT16P08779 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT16P08779 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT16P08779 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT16P08779 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT16P08779 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT16P08779 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT16P08779 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT16P08779 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT16P08779 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT16P08779 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT16P08779 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT16P08779 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT16P08779 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT16P08779 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT16P08779 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT16P08779 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT16P08779 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT16P08779 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT16P08779 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms