Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCGP05129 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCGP05129 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCGP05129 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms