Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB2P05107 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB2P05107 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB2P05107 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms