Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMG1P04279 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMG1P04279 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEMG1P04279 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMG1P04279 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms