Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCAP01258 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALCAP01258 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALCAP01258 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCAP01258 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCAP01258 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCAP01258 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCAP01258 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALCAP01258 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALCAP01258 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALCAP01258 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALCAP01258 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALCAP01258 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALCAP01258 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALCAP01258 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALCAP01258 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALCAP01258 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALCAP01258 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALCAP01258 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALCAP01258 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALCAP01258 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALCAP01258 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALCAP01258 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALCAP01258 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALCAP01258 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALCAP01258 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALCAP01258 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALCAP01258 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALCAP01258 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALCAP01258 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALCAP01258 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALCAP01258 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALCAP01258 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CALCAP01258 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALCAP01258 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALCAP01258 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALCAP01258 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALCAP01258 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALCAP01258 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALCAP01258 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALCAP01258 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALCAP01258 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALCAP01258 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALCAP01258 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALCAP01258 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALCAP01258 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALCAP01258 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALCAP01258 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALCAP01258 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CALCAP01258 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CALCAP01258 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALCAP01258 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALCAP01258 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALCAP01258 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALCAP01258 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALCAP01258 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALCAP01258 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALCAP01258 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALCAP01258 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALCAP01258 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALCAP01258 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCAP01258 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCAP01258 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCAP01258 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCAP01258 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCAP01258 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCAP01258 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCAP01258 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCAP01258 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCAP01258 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCAP01258 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCAP01258 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALCAP01258 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALCAP01258 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALCAP01258 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALCAP01258 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALCAP01258 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CALCAP01258 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALCAP01258 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CALCAP01258 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALCAP01258 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALCAP01258 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALCAP01258 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALCAP01258 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALCAP01258 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALCAP01258 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALCAP01258 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALCAP01258 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALCAP01258 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALCAP01258 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALCAP01258 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALCAP01258 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALCAP01258 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALCAP01258 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALCAP01258 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALCAP01258 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALCAP01258 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALCAP01258 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALCAP01258 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALCAP01258 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms