Protein–RNA interactions for Protein: P00445

SOD1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], yeast

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	P00445	YML079W	YML079W	606 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SOD1	P00445	PTH2	YBL057C	627 nt		5.6	□□□□□ -1.51
SOD1	P00445	YDR306C	YDR306C	1437 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SOD1	P00445	CMK2	YOL016C	1344 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SOD1	P00445	RDN5-2	RDN5-2	119 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SOD1	P00445	RDN5-3	RDN5-3	119 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SOD1	P00445	RDN5-4	RDN5-4	119 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SOD1	P00445	RDN5-5	RDN5-5	119 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SOD1	P00445	BRN1	YBL097W	2265 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	GTT3	YEL017W	1014 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	GET4	YOR164C	939 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	snR30	snR30	606 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	YCR061W	YCR061W	1896 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	NAF1	YNL124W	1479 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	PPH22	YDL188C	1134 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	PRS4	YBL068W	981 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	Q0010	Q0010	387 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	YEL023C	YEL023C	2049 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	PHO3	YBR092C	1404 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	ECM27	YJR106W	2178 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	CIA1	YDR267C	993 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	YOL099C	YOL099C	492 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	CST26	YBR042C	1194 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	RPL5	YPL131W	894 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	PUP2	YGR253C	783 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	GUT1	YHL032C	2130 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	YAL019W-A	YAL019W-A	570 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	HMS2	YJR147W	1077 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	YCL049C	YCL049C	939 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	TUF1	YOR187W	1314 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	STF1	YDL130W-A	261 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	NTG2	YOL043C	1143 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	PAC2	YER007W	1557 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	RGD2	YFL047W	2145 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	YNR005C	YNR005C	405 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	HTZ1	YOL012C	405 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SOD1	P00445	REC107	YJR021C	945 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	YOR268C	YOR268C	399 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	MLS1	YNL117W	1665 nt		5.51	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	YIP4	YGL198W	708 nt		5.51	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	SPG5	YMR191W	1122 nt		5.51	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	PRE5	YMR314W	705 nt		5.51	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	FCY22	YER060W-A	1593 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	URH1	YDR400W	1023 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	TRS31	YDR472W	852 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	DYS1	YHR068W	1164 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	TPK1	YJL164C	1194 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	YLR162W	YLR162W	357 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	RPL31B	YLR406C	342 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	PEX31	YGR004W	1389 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	APE4	YHR113W	1473 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	YPL247C	YPL247C	1572 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	VMA2	YBR127C	1554 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	AVT4	YNL101W	2142 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	TOS2	YGR221C	1869 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	YLL058W	YLL058W	1728 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	CBR1	YIL043C	855 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	RPR1	RPR1	369 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	YNL200C	YNL200C	741 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	KNS1	YLL019C	2214 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	HEL1	YKR017C	1656 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	ISC1	YER019W	1434 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	VBA5	YKR105C	1749 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	YJL144W	YJL144W	315 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	PAB1	YER165W	1734 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	HSM3	YBR272C	1443 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	YPR204W	YPR204W	3099 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	PTC7	YHR076W	1032 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	YUR1	YJL139C	1287 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SOD1	P00445	CIR2	YOR356W	1896 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	MRPS28	YDR337W	861 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	YFL013W-A	YFL013W-A	804 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	AIM46	YHR199C	933 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	GCN3	YKR026C	918 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	YOX1	YML027W	1158 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	CUE4	YML101C	354 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	LAT1	YNL071W	1449 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	NOG2	YNR053C	1461 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	MIP1	YOR330C	3765 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	HIS1	YER055C	894 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	YGL102C	YGL102C	429 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	SMX3	YPR182W	261 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	ADH5	YBR145W	1056 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	ARG81	YML099C	2643 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	CEF1	YMR213W	1773 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	YDL177C	YDL177C	513 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	YSC83	YHR017W	1158 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	YJR107W	YJR107W	987 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	AIM33	YML087C	939 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	ZIM17	YNL310C	525 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	ICP55	YER078C	1536 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	TKL2	YBR117C	2046 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	PRI1	YIR008C	1230 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	SML1	YML058W	315 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	ARO7	YPR060C	771 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	YJL163C	YJL163C	1668 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	YMR034C	YMR034C	1305 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	SKI2	YLR398C	3864 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	MSC3	YLR219W	2187 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SOD1	P00445	YKR032W	YKR032W	315 nt		5.42	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.5 ms