Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA4FO95754 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA4FO95754 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA4FO95754 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA4FO95754 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms