Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MATN4O95460 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MATN4O95460 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MATN4O95460 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MATN4O95460 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MATN4O95460 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MATN4O95460 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MATN4O95460 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MATN4O95460 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MATN4O95460 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MATN4O95460 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MATN4O95460 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN4O95460 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN4O95460 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN4O95460 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN4O95460 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN4O95460 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN4O95460 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN4O95460 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN4O95460 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN4O95460 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN4O95460 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN4O95460 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MATN4O95460 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MATN4O95460 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MATN4O95460 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MATN4O95460 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MATN4O95460 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MATN4O95460 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MATN4O95460 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MATN4O95460 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MATN4O95460 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MATN4O95460 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MATN4O95460 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MATN4O95460 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MATN4O95460 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MATN4O95460 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MATN4O95460 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MATN4O95460 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MATN4O95460 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MATN4O95460 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MATN4O95460 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MATN4O95460 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MATN4O95460 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MATN4O95460 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MATN4O95460 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MATN4O95460 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MATN4O95460 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MATN4O95460 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MATN4O95460 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MATN4O95460 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MATN4O95460 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MATN4O95460 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MATN4O95460 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MATN4O95460 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MATN4O95460 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MATN4O95460 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MATN4O95460 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MATN4O95460 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MATN4O95460 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MATN4O95460 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MATN4O95460 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MATN4O95460 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MATN4O95460 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MATN4O95460 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MATN4O95460 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MATN4O95460 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MATN4O95460 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MATN4O95460 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MATN4O95460 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MATN4O95460 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN4O95460 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN4O95460 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN4O95460 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN4O95460 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN4O95460 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN4O95460 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN4O95460 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN4O95460 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN4O95460 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN4O95460 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN4O95460 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN4O95460 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN4O95460 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN4O95460 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MATN4O95460 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MATN4O95460 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MATN4O95460 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MATN4O95460 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MATN4O95460 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MATN4O95460 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MATN4O95460 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MATN4O95460 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MATN4O95460 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MATN4O95460 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN4O95460 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN4O95460 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN4O95460 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MATN4O95460 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MATN4O95460 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms