Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX4O95219 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX4O95219 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX4O95219 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX4O95219 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX4O95219 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX4O95219 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX4O95219 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX4O95219 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX4O95219 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX4O95219 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX4O95219 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX4O95219 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX4O95219 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX4O95219 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX4O95219 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX4O95219 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX4O95219 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX4O95219 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX4O95219 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX4O95219 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX4O95219 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX4O95219 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX4O95219 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX4O95219 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX4O95219 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX4O95219 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX4O95219 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX4O95219 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX4O95219 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX4O95219 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX4O95219 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX4O95219 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX4O95219 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX4O95219 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX4O95219 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX4O95219 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX4O95219 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX4O95219 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX4O95219 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX4O95219 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX4O95219 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX4O95219 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX4O95219 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX4O95219 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX4O95219 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX4O95219 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX4O95219 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX4O95219 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX4O95219 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX4O95219 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX4O95219 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX4O95219 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX4O95219 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX4O95219 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX4O95219 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX4O95219 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX4O95219 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX4O95219 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX4O95219 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX4O95219 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX4O95219 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX4O95219 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX4O95219 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX4O95219 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX4O95219 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX4O95219 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX4O95219 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX4O95219 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX4O95219 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX4O95219 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX4O95219 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX4O95219 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX4O95219 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX4O95219 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX4O95219 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX4O95219 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX4O95219 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX4O95219 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX4O95219 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX4O95219 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX4O95219 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX4O95219 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX4O95219 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX4O95219 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX4O95219 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX4O95219 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX4O95219 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX4O95219 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX4O95219 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX4O95219 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX4O95219 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX4O95219 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX4O95219 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX4O95219 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX4O95219 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX4O95219 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX4O95219 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX4O95219 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX4O95219 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms