Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN7O94888 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
UBXN7O94888 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN7O94888 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN7O94888 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms