Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR2O75167 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR2O75167 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR2O75167 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR2O75167 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHACTR2O75167 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR2O75167 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms